После дождей?
Или это обычное состояние воды в это время года?

Наверное, причин несколько: 1. слабый водообмен, 2. относительно высокая температура воды, способствующая бурному размножению микроорганизмов, 3. отсутствие системы, задача которой заключалась бы в очищении искусственных водных путей. Про последний пункт - это в значительной мере мои фантазии, хотя, где-то я читал, что это практикуется в некоторых странах.
Напомнило вот это: https://ru.wikipedia.org/wiki/%D5%F3%E0%ED%F5%FD
Спасибо всем за плюсики)

Так же можно принять во внимание то что суда, особенно те которые грузятся по максимуму, поднимают муть со дна работой винтов. Плюс ко всему потоки воды курсирующие из шлюза в шлюз могут привести к такому цвету воды (аналог работы винтов судна). Да и плавающие водоросли и куски травы намекаю на это.